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第1章 基因定位1

单元1.1 连锁研究所需临床和流行病学资料的收集3

单元1.2 家系选择和信息含量11

单元1.3 单精子分型17

单元1.4 采用LINKAGE软件包进行连锁分析25

单元1.5 非模式依赖的遗传连锁检验50

单元1.6 利用DNA池技术进行纯合子定位65

单元1.7 疾病关联和基于家系的检验69

单元1.8 基因-基因相互作用的分析81

第2章 基因分型88

单元2.1 基于PCR的基因分型方法88

单元2.2 基于连接分析的分型方法99

单元2.3 自动荧光的分型方法103

单元2.4 用微阵列的方法分型单核苷酸多态109

单元2.5 使用TAQMAN分析法的高通量基因分型119

单元2.6 使用引物延伸荧光偏振探测法的高通量基因分型121

第3章 体细胞杂交简介127

单元3.1 体细胞杂交的构建127

第4章 细胞遗传学139

单元4.1 经培养外周血细胞的染色体制备140

单元4.2 小鼠细胞染色体制备及核型分析144

单元4.3 染色体显带技术151

单元4.4 中期染色体和间期核的原位杂交159

单元4.5 高分辨率FISH分析167

单元4.6 多色荧光原位杂交（FISH）方法分析人类完全基因组176

单元4.7 应用形态学抗体染色体技术确定细胞的表型与基因型181

单元4.8 比较基因组杂交196

第5章 大片段的克隆和分析202

单元5.1 大范围限制性图谱：脉冲电场电泳203

单元5.2 用杂交的方法筛选大片段插入的文库209

单元5.3 胚胎将大片段插入DNA导人哺乳动物细胞和胚胎219

单元5.4 BAC/PAC文库的构建232

第6章 确定基因组DNA候选基因246

单元6.1 基因鉴定：方法和注意事项246

单元6.2 序列数据库：整体信息的检索和数据的提交257

单元6.3 使用BLAST程序家族查找序列相似性265

单元6.4 人类基因组的获取280

单元6.5 使用Entrez来检索NCBI数据库303

第7章 搜寻候选基因突变的方法316

单元7.1 患病个体的序列扩增317

单元7.2 通过单链构象多态性分析检测基因突变321

单元7.3 毛细管电泳法分析单链构象多态性323

单元7.4 应用基于荧光的自动化测序进行杂合体检测328

单元7.5 用循环测序法检测突变333

单元7.6 人类突变数据库337

第8章 临床细胞遗传学345

单元8.1 绒毛标本分裂中期染色体涂片制备346

单元8.2 羊水标本的制备、培养和分析349

单元8.3 用于染色体分析的妊娠产物及其他固体组织来源样本的培养及制备357

单元8.4 姐妹染色单体互换（SCE）分析361

单元8.5 利用石蜡包埋组织鉴定染色体非整倍体365

单元8.6 羊水细胞用于间期核FISH分析的制备方法369

单元8.7 范可尼贫血（先天性骨髓发育不全）的诊断——二氧桥丁烷（双环氧丁烷）检测374

第9章 临床分子遗传学380

单元9.1 运用多重PCR检测营养不良基因缺失381

单元9.2 利用等位基因特异性寡聚核苷酸（Allelespecific oligonucleotide，ASO）同时检测多点突变391

单元9.3 脆性X综合征的分子分析394

单元9.4 肌强直性肌营养不良（myotonic dystrophin，DM）的三核苷酸重复的分析399

单元9.5 非随机X染色体失活的检测404

单元9.6 父子关系的分子分析406

单元9.7 点突变不易扩增突变系统（简称ARMS）分析415

单元9.8 线粒体DNA突变缺失氧化磷酸化疾病的分子分析421

单元9.9 单细胞DNA和FISH分析应用于植入前基因诊断434

单元9.10 蛋白质截短试验447

单元9.11 载脂蛋白E（apolipoprotein E，APOE）基因型分析：不同方法间比较456

第10章 癌基因组学462

单元10.1 收获分裂中期的细胞对恶性肿瘤患者的血液标本进行细胞遗传学分析463

单元10.2 实体瘤培养分裂中期细胞的收获和细胞遗传学分析467

单元10.3 分子生物学方法分析白血病和非霍奇金氏淋巴瘤的DNA重组470

单元10.4 肿瘤中基因扩增的分子分析483

单元10.5 甲基化特异性PCR490

第11章 转录谱494

单元11.1 用于表达监测的寡核苷酸分析494

单元11.2 用cDNA芯片分析人类基因表达504

单元11.3 表达数据分析概述514

第12章 基因治疗载体519

单元12.1 基因转移载体的生物安全性问题520

单元12.2 腺病毒载体523

单元12.3 重组腺相关病毒载体的生产538

单元12.4 反转录病毒载体的制备546

单元12.5 假包膜型反转录病毒载体的制备555

单元12.6 高滴定度慢病毒载体产物558

单元12.7 构建复制缺陷型疱疹单纯病毒载体564

单元12.8 应用辅助病毒缺陷HSV-1扩增载体进行基因传递579

单元12.9 脂质体载体用于直接体内基因转染587

第13章 基因治疗的转移系统589

单元13.1 动脉的基因转移590

单元13.2 基因传递到肌肉598

单元13.3 脑的基因转移：间接体内法和直接体内法606

单元13.4 人造血干细胞的培养、转导和分析614

单元13.5 呼吸道基因给药627

单元13.6 基因传递到肝脏641

参考文献826

附录1 试剂与溶液644

附录2 有用的信息和数据718

附录2A 人类重复DNA序列概述718

附录2B ISCN标准核型模式图720

附录2C 遗传连锁参考图谱：基于互联网资源的入口737

附录2D 放射性同位素数据738

附录2E 离心机和转子739

附录3 常用技术744

附录3A 从哺乳动物细胞中提取基因组DNA744

附录3B DNA的抽提和沉淀747

附录3C 从固定的石蜡包埋组织切片中制备DNA749

附录3D 使用分光光度计和荧光分光光度计测定DNA和RNA的含量751

附录3E DNA酶标记法754

附录3F 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳757

附录3G Southern杂交法分析DNA760

附录3H Northern杂交分析RNA764

附录3I 哺乳动物细胞组织培养技术767

附录3J 通过EB病毒转化建立恒定的细胞系774

附录3K 核型分析777

附录4 一些试剂和仪器提供商779

索引837