基因开关 再访入口噬菌体PDF|Epub|txt|kindle电子书版本网盘下载

基因开关 再访入口噬菌体PDF格式电子书版下载

注意：本站所有压缩包均有解压码： 点击下载压缩包解压工具

绪论1

1 调控的主要因素11

1.1　开关的组分14

1.1.1　DNA14

1.1.2　RNA聚合酶15

1.1.3 阻抑物16

1.1.4　Cro17

1.2　阻抑物和Cro的作用18

1.2.1 负调控18

1.2.2　正调控19

1.2.3　阻抑物结合的协同效应21

1.3　诱导——扳动开关23

1.4　协同效应——开关的稳定性和灵敏性27

1.5　自我调节的作用29

1.6　其他情况30

进一步阅读：相关综述30

2　蛋白－DNA相互作用和基因调控32

2.1　操纵基因32

2.2　阻抑物35

2.3　Cro39

2.4　氨基酸－碱基对之间的相互作用40

2.5　启动子44

2.6　基因调控46

进一步阅读：相关综述48

3　控制回路——设置开关49

3.1.1　遗传图谱50

3.1　λ生长的简单概述50

3.1.3　基因表达52

3.1.2　环化52

3.1.4　整合53

3.2　转录的调控54

3.2.1　极早期54

3.2.2　早期55

3.2.3　晚期裂解56

3.2.4　晚期溶原化57

3.3　决定58

3.4.1　情况1——建立溶原化60

3.4.2　情况2——裂解生长60

3.4　整合和切除的控制60

3.4.3　情况3——诱导62

3.5　其他噬菌体62

3.6　SOS反应63

3.7　λ途径和细胞发育65

3.7.1　调节基因65

3.7.2　开关67

3.7.3　基因表达模式68

进一步阅读：相关综述69

4　关键实验的启示70

4.1　阻抑物概念70

4.1.1 清澈和毒性突变70

4.1.2　免疫力和异种免疫力72

4.1.3 细菌交配的不对称性73

4.2　20世纪60年代早期的阻抑物蛋白74

4.3　阻抑物的分离和DNA结合75

4.4　制造更多阻抑物78

4.5　第1章、第2章的解释79

4.5.1 阻抑物的组成79

4.5.2 阻抑物的二聚化81

4.5.3 阻抑物二聚体与操纵基因位点的结合81

4.5.4　右向操纵基因与Cro的结合88

4.5.5 阻抑物与OR的结合90

4.5.6　溶原体中阻抑物的结合及其转录调控91

4.5.7　Cro与OR的结合97

4.5.8　RecA切割阻抑物引起诱导作用（图1-21）100

4.5.9 当Cro结合到OR3时开关被打开（图1-24）101

4.5.10 阻抑物和Cro与操纵基因的结合101

4.5.11 阻抑物通过结合OR2并通过它的氨基端结构城与聚合酶的接触激活cI的转录105

4.6　结论110

进一步阅读：综述文章111

研究论文111

5　2004：新进展115

5.1　长程协同效应和PRM的抑制115

5.1.1 阻抑物八聚体结合OR和OL117

5.1.2　阻抑物合成的自我负调控118

5.1.3　长程相互作用和PR的阻抑作用119

5.1.5　PRM的激活和阻抑121

5.1.6 阻抑物结构121

5.1.4 长程相互作用和PRM的阻抑作用121

5.2　正调控（转录激活）129

5.2.1　聚合酶和启动子130

5.2.2　激活机制130

5.2.3　激活区域的变种131

5.2.4　pc突变的抑制基因（suppressor）132

5.2.5　晶体学133

5.2.6　激活旁路133

5.2.7 改变激活区域和靶点的上下游序列136

5.3　阻抑物单体的结构和阻抑物断裂的机制139

5.4　开关的进化142

5.4.1 改变OR中位点对阻抑物的亲和力142

5.4.3 除去DNA结合二聚体之间的协同性143

5.4.2　除去正调控143

5.5　CⅡ和决定145

参考文献：书籍和综述147

参考文献：研究论文148

附录151

A1　设计有效的DNA结合蛋白151

A1.1　大纲151

A1.2　特异性和非特异性结合151

A1.3　增加特异性154

A1.4　利用协同性155

A1.5 真核生物中的DNA－蛋白相互作用157

进一步阅读：研究论文158

A2　强弱相互作用159

索引160