信号转导手册 4 蛋白质互作、环化核苷酸 英文PDF|Epub|txt|kindle电子书版本网盘下载

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导读版第①卷 细胞内外信号转导机制1

1．细胞信号转导：昨天、今天和明天1

第一部分 起始：胞外及质膜事件5

A 分子识别9

2．分子识别的结构和能量基础11

3．蛋白与蛋白相互作用的自由能概貌15

4．分子社会学23

5．抗原-抗体识别及其构象变化29

6．抗原-抗体界面处的结合热力学37

7．免疫球蛋白-Fc受体相互作用41

8．免疫球蛋白超折叠及其在分子识别中的多种用途49

9．T细胞受体／pMHC复合体55

10．细胞表面黏附受体的机制特征63

11．免疫突触71

12．NK受体77

13．碳水化合物的识别与信号转导85

14．鼻病毒与其受体的相互作用93

15．Ⅰ-型人免疫缺陷病毒与其受体的相互作用97

16．流感病毒神经氨酸酶的抑制剂103

17．涉及血液纤维蛋白原及纤维蛋白的信号事件的结构基础111

18．整合素信号的结构基础115

19．G蛋白异源三聚体及其复合物的结构119

20．G蛋白偶联受体的结构129

21．Toll样受体的结构与信号139

22．多种多样的淋巴细胞受体145

B 多通路受体149

23．G蛋白偶联受体的结构与功能：从最近发现的晶体结构得到的启示151

24．趋化因子及其受体的结构与功能157

25．G蛋白偶联受体的结构及其被可扩散激素所激活的过程（参照β2型肾上腺素受体模型）163

26．蛋白酶激活的受体171

27．由激动剂导致的G蛋白偶联受体的脱敏及细胞内吞化作用177

28．由G蛋白偶联受体形成的二聚化复合体的功能185

29．细菌中的趋化性受体：跨膜信号，敏感性，匹配及受体聚集195

30．离子通道结构概论201

31．STIM和Orai介导的钙库依赖性钙信号及CRAC离子通道激活的分子机制209

32．离子渗入性：离子选择性与进入阻断的机制217

33．烟碱乙酰胆碱受体221

34．与核苷酸环化酶直接结合而被调节的离子通道225

C 对受体的横向比较研究233

35．细胞因子受体概述235

36．生长激素与泌乳激素家族及其受体：受体激活和调节的结构基础237

37．以促红细胞生成素受体为例的细胞因子信号245

38．纤维原细胞生长因子（FGF）信号复合体253

39．γ干扰素及其受体的结构261

40．肿瘤坏死因子（TNF）的结构及其在细胞表面的功能265

41．神经生长因子的信号机制（以p75和TrkA受体复合体为例）277

42．血管内皮生长因子对其受体的激活机制287

43．肿瘤生长因子β超家族中的受体-配体识别：其外部结构域复合物晶体结构的启示293

44．胰岛素受体复合物及胰岛素介导的信号通路301

45．胰岛素受体酪氨酸激酶的结构与机制307

46．白介素21增强的药效设计315

47．典型的第一类细胞因子受体——白介素4R的信号通路：静止态是如何定义的323

48．表皮生长因子激酶及其在受体介导的信号通路中的激活329

D 膜近端事件337

49．肿瘤坏死因子受体偶联因子在免疫受体信号转导中的作用339

50．肿瘤坏死因子受体家族分子的信号复合体组装347

51．CD40在免疫系统中的信号机制353

52．脂类结构域在表皮生长因子受体信号通路中的作用359

53．脂类介导的信号蛋白定位365

54．光受体信号复合体的组织373

55．跨膜受体多聚化379

导读版第②卷 蛋白质磷酸化和去磷酸化第二部分 传递：效应物及胞浆事件385

A 蛋白磷酸化391

56．真核激酶组学：蛋白激酶的基因组与进化393

57．在细胞交流中模块蛋白的互作结构域399

58．丝／苏氨酸及酪氨酸激酶的结构413

59．蛋白酪氨酸激酶受体信号概述419

60．血小板来源的生长因子受体家族信号通路427

61．表皮生长因子受体家族435

62．Eph受体信号的机制与功能443

63．细胞因子受体信号通路451

64．JAK/STAT信号通路的负调控467

65．蛋白激酶的抑制物481

66．整合信号：细胞的迁移、增殖与存活491

67．下游信号通路：模块的互作501

68．非受体型酪氨酸激酶在T细胞抗原受体功能中的作用507

69．受体酪氨酸激酶信号及泛素化517

70．肿瘤生长因子β的信号转导521

71．有丝分裂原激活的蛋白激酶533

72．由磷酸化的丝／苏氨酸结合结构域介导的对丝／苏氨酸磷酸化蛋白质的识别539

73．单磷酸腺苷激活的蛋白激酶551

74．激酶调节的原则559

75．钙／钙调蛋白依赖的蛋白激酶Ⅱ565

76．糖原合成激酶3569

77．PIKK蛋白激酶家族575

78．在双组分信号通路中的组氨酸激酶581

79．非典型性蛋白激酶：EF2K/MHCK/TR-PM7家族587

80．拟南芥的富亮氨酸重复受体蛋白激酶——植物LRR受体的范例601

81．构建对非自然核苷酸或抑制剂具特异性的蛋白激酶609

82．激酶抑制剂在实体瘤中的临床应用615

83．在NFkB信号通路中由泛素化介导的蛋白激酶的调节633

84．对磷酸化调节网络的整体性分析645

B 蛋白去磷酸化657

85．对蛋白的丝氨酸及苏氨酸残基去磷酸化的磷酸酶家族659

86．蛋白丝／苏氨酸磷酸酶的基本结构及拓扑结构677

87．蛋白丝／苏氨酸磷酸酶的天然抑制剂683

88．蛋白磷酸酶1结合蛋白689

89．蛋白丝／苏氨酸磷酸酶抑制剂及人类疾病699

90．钙调蛋白磷酸酶705

91．蛋白丝／苏氨酸磷酸酶2C（PP2C）711

92．识别蛋白酪氨酸磷酸酶底物的方法717

93．蛋白酪氨酸磷酸酶的抑制剂727

94．PTP受体活性的调节737

95．CD45743

96．Cdc14磷酸酶的调节及其细胞周期功能749

97．MAP激酶磷酸酶755

98．包含SH2结构域的蛋白酪氨酸磷酸酶771

99．胰岛素受体PTP:PTP1B811

100．STYX/Dead磷酸酶817

101．斑马鱼与磷酸酶功能827

102．Eya蛋白酪氨酸磷酸酶：一类新的真核脱卤化酶超家族835

103．PHLPP：含PH结构域及富亮氨酸重复基序的蛋白磷酸酶843

104．PTEN849

105．PTP的氧化855

106．细胞骨架调节中的Choronophin与Slingshot cofilin磷酸酶863

107．蛋白酪氨酸磷酸酶的大尺度结构分析871

108．蛋白磷酸酶与生物钟877

导读版第③卷 钙离子信号转导、脂质介导的第二信使C 钙信号转导883

109．钙信号：信使、传输通路、感受器及生理效果885

110．磷脂酶C887

111．环化ADP-核糖与NAADP893

112．电压门控的钙通道897

113．钙库偶联的钙通道911

114．花生四烯酸调节的钙通道915

115．IP3受体921

116．Ryanodine受体927

117．细胞内钙信号937

118．钙泵943

119．钠／钙交换949

120．Ca2＋缓冲955

121．线粒体是细胞钙信号网络的组织者963

122．EF-手蛋白与钙的感受：神经元钙感应蛋白973

123．钙调蛋白介导的信号通路979

124．S100细胞信号蛋白家族983

125．膜联蛋白Annexin与钙信号995

126．钙依赖蛋白酶Calpain999

127．平滑肌中的钙信号1009

128．心肌中的钙信号1027

D 脂来源的第二信使1031

129．历史回顾：蛋白激酶C、佛波酯及脂类递质1033

130．Ⅰ型磷脂酰肌醇-4-磷酸-5-激酶（PI4P5-激酶）1037

131．Ⅱ型PIP4激酶1043

132．磷酸肌醇3-激酶1049

133．PTEN/MTM磷脂酰肌醇磷酸酶1061

134．含有SH2结构域的5'肌醇磷酸酶1065

135．脂类第二信使识别的结构原则1085

136．Pleckstrin同源（PH）结构域1093

137．PX结构域1103

138．膜运输及细胞信号中的FYVE结构域1111

139．蛋白激酶C：从脂类水解到蛋白磷酸化的信号接力1123

140．磷酸肌醇对单体G蛋白的调节1131

141．磷酸肌醇与肌动蛋白细胞骨架的重构1141

142．磷脂酰肌醇转运蛋白1151

143．肌醇羟基五磷酸盐——信号转导中心1159

144．磷脂酶D1167

145．二酯酰甘油激酶1177

146．1-磷酸-鞘氨醇受体：最新进展1183

147．溶血磷脂酸及1-磷酸-鞘氨醇对G蛋白偶联受体的激活1191

148．神经酰胺在细胞调节中的作用1201

149．磷脂酶A2在花生四烯酸动员中的作用与花生酸的产生1213

150．前列腺素递质1219

151．白三烯递质1229

152．脂氧素与阿司匹林诱发的15-磊晶脂氧素：在抗炎与炎症消退中的消退递质前体1235

导读版第④卷 蛋白质互作、环化核苷酸E 蛋白临近互作1243

153．蛋白临近互作1245

154．体内磷酸化位点的快速识别及蛋白激酶和磷酸酶通过亲合捕获对这些位点的调节1247

155．FRET法对胞内信号事件的分析1253

156．局部黏附：分子互作的网络1259

157．WASP及WAVE家族蛋白复合体1265

158．突触NMDA受体信号复合体1271

159．Toll家族受体1277

160．信号转导与免疫突触1283

161．泛素-蛋白酶体系统1293

162．半胱天冬氨酸蛋白水解酶：蛋白降解引发的细胞信号1297

163．酵母中的MAP激酶1303

164．哺乳动物MAP激酶1315

165．由AKAP介导的PKA亚细胞靶点：保守的铆定结构域与独特的靶点结构域1329

166．AKAP转导单位：背景依赖的信号复合体组装1337

167．树突蛋白磷酸酶复合体1343

168．蛋白磷酸酶2A1353

169．14-3-3蛋白1367

170．蛋白互作数据资源1375

F 环化核苷酸1387

171．腺苷酸环化酶1389

172．鸟苷酸环化酶1399

173．磷酸二酯酶家族1409

174．cAMP特异性的磷酸二酯酶：多种识别cAMP信号特征与定位的一类酶1415

175．cAMP/cGMP双重特异性的磷酸二酯酶1425

176．磷酸二酯酶-51439

177．光受体磷酸二酯酶（PDE6）在视觉信号途径中的功能与调节1445

178．通过鳌合调节环化核苷酸水平1453

179．cAMP依赖的蛋白激酶1461

180．cGMP依赖的蛋白激酶：靶向及表达控制1471

181．cAMP及cGMP依赖性蛋白激酶的抑制剂1479

182．环化核苷酸依赖的蛋白激酶的底物1489

183．PKA和PKG的生理底物1497

184．cGMP依赖的蛋白激酶敲除效应1515

185．环化核苷酸调节的阳离子通道1519

186．Epac,cAMP调节的Rap1和Rap2的鸟嘌呤核苷酸交换因子1525

187．在磷酸二酯酶和腺苷酸环化酶中结合环化核苷酸的GAF结构域1531

188．利用嵌合型腺苷酸环化酶来研究环化核苷酸信号通路1537

189．动体目原生动物中的环化核苷酸信号1543

190．环化核苷酸的特异性与环化核苷酸受体的交叉激活1549

191．用于研究环化核苷酸信号通路的环化核苷酸类似物1555

192．血小板中的cGMP和PKG信号1563

193．应用siRNA及反义链敲减研究PKI对PKA的调节1569

194．中枢神经系统中的环化核苷酸信号1573

195．心肌细胞中cAMP的区室化1581

196．磷酸二酯酶9A:cGMP特异性的酶1589

导读版第⑤卷 G蛋白、发育生物学中的信号转导G G蛋白1595

197．G蛋白的信号转导：基本原则、分子多样性及其行为的结构基础1597

198．在原子分辨率下的异三聚G蛋白信号1615

199．异三聚体G蛋白的体内功能1621

200．共价修饰对G蛋白的调节1629

201．G蛋白偶联受体、信号保真及细胞转化1635

202．通过Gz传导的信号1649

203．Gαo的效应物1655

204．异三聚体G蛋白的单ADP核糖基化1665

205．G蛋白βγ二聚物信号的特异性1673

206．G蛋白信号调节者（RGS）超家族1683

207．化学趋向性中的G蛋白信号1705

208．在G蛋白信号通路中可逆的棕榈酰化作用1713

209．G蛋白在味觉转导中的行为1721

210．由异三聚体G蛋白调节的突触融合1727

211．通道的G蛋白调节1735

212．Ras蛋白与癌症1741

213．细胞内定位对Ras蛋白功能的影响1745

214．R-Ras在细胞生长中的作用1753

215．Ran GTPase：细胞作用与调节1763

216．Rac GTPase对NADPH氧化酶的调节1773

217．Rac和Rho在细胞周期进程中的作用1781

218．Cdc42及其细胞功能1785

219．组织中谷氨酰胺转移酯酶：一种独特的GTP结合／GTPase1795

220．ADP核糖基化因子在膜转运中的作用1803

221．酵母小G蛋白的功能：酵母中细胞极性的分子基础1813

222．法尼基转移酶的抑制剂1819

223．Rho家族靶点的结构1827

224．RhoGEF的结构特征1843

225．小GTP结合蛋白的结构思考1849

226．Mx蛋白：有着抗病毒活性的高分子量GTPase1855

H 发育信号1865

227．Wnt/β-catenin/Fgf之间的相互作用与在侧线形态生成中的趋化因子信号1867

228．Wnt信号在发育中的作用1873

229．Hedgehog信号在发育与疾病中的作用1879

230．钙对脊椎动物左右轴发育的调节1885

231．LIN-12/Notch信号：诱导、侧向特异性及与EGF/Ras通路的互作1891

232．Notch信号的蛋白降解激活：配体内吞与机械转导1897

233．BMP在发育中的作用1905

234．神经营养因子在发育中的作用1913

235．不同生物学反应中背景依赖的VEGF信号机制1919

236．血管内皮生长因子及其受体：血管发育中的信号转导1927

237．成纤维生长因子受体在发育与疾病中的信号1939

238．受体蛋白酪氨酸磷酸酶在轴突路径导航中的作用1949

239．神经生长椎导向中的吸引与排斥信号1955

240．脊椎及无脊椎动物中的Semaphorin蛋白及其受体1961

241．在胚胎脊髓发育中调节细胞命运的信号通路1967

242．黏附互作的钙粘蛋白调节1975

243．通过Smadl磷酸化实现的BMP、RTK及Wnt信号的整合1989

导读版第⑥卷 转录与翻译：细胞核与细胞质事件第三部分 转录与翻译：细胞核与细胞质事件1995

A 核受体1997

244．核受体共激活因子1999

245．在核受体介导的抑制中的辅阻遏物2005

246．类固醇激素受体信号2015

247．COUP-TFII在先天性横隔膜疝气中的作用2021

248．黑腹果蝇中的核受体2027

B 转录因子2039

249．JAK-STAT信号2041

250．FOXO转录因子：PI3K-Akt通路的关键靶点，调节细胞增殖、存活及机体衰老2049

251．转录因子AP-1的多基因家族2059

252．NFkB：细胞信号的关键整合者2069

253．通过cAMP应答激活因子CREB的转录调节2077

254．NFAT家族：结构、调节及生物学功能2083

255．泛素／蛋白酶体2093

256．Smad蛋白2099

C 损伤／应激反应2105

257．压力信号的复杂性2107

258．在大肠杆菌SOS反应中的信号转导2127

259．氧化压力与自由基信号转导2137

260．利用啤酒酵母鉴别DNA双链损伤信号必需基因的筛选方法2145

261．果蝇的辐射应答2159

262．由非同源性末端联结介导的双链断裂识别及其修复2165

263．保护基因组完整性的ATM介导信号2171

264．由基因毒性和非基因毒性压力激活通路介导的p53肿瘤抑制信号2185

265．总调节者p53及其与靶序列互作的规则2205

266．Abl酪氨酸激酶的细胞核及胞浆功能2217

267．射线诱导的细胞质信号2225

268．热休克反应及错误折叠蛋白的应激反应2231

269．缺氧介导的信号通路2241

270．细胞压力对mRNA降解的调节2247

271．癌基因的应激反应2257

272．泛素及FANC应激反应2265

273．应激与γ-H2AX2273

D 转录后控制2283

274．氨基酸与能量对翻译的控制2285

275．翻译控制与胰岛素信号2295

276．内质网与氧化压力：疾病的暗示2301

277．mRNA降解的调节2311

278．胞质中的多腺苷化信号与翻译2317

279．无脊椎动物发育中的翻译控制2323

280．选择性剪接在细胞周期与程序性细胞死亡中的作用2329

281．介导mRNA招募核糖体的翻译控制的信号通路2335

E 染色质及其修饰2343

282．SWI/SNF及RSC核小体重塑复合体2345

283．ISWI染色质重塑复合体2357

284．INO80染色质重塑复合体2363

285．组蛋白乙酰化复合体2369

286．由磷酸化和去磷酸化实现的组蛋白脱乙酰酶活性及功能调节2379

287．组蛋白甲基化：化学惰性的但是染色质动态的2389

288．组蛋白磷酸化：将细胞信号通路与核功能调控联系起来的染色质修饰2399

289．组蛋白变种：信号还是结构模块？2409

290．啤酒酵母中沉默染色质的形成与调节2427

291．在果蝇与人中由Polycomb复合体介导的染色质修饰与基因沉默2437

292．组蛋白泛素化2449

293．染色质介导的先天免疫及炎症中的基因表达控制2461

导读版第⑦卷 细胞内功能区隔信号转导、胞间和细胞基质间的相互作用、疾病病理学第四部分 细胞内功能区信号转导2467

294．内质网中的蛋白质量控制2471

295．线粒体中的质量控制与保证2477

296．过氧化物酶体中的蛋白质量控制：过氧化物酶体目标信号受体的泛素化2489

297．线粒体动力学：融合与分离2499

298．SREBP通路：通过固醇感应及门控蛋白运输实现的基因调控2505

299．通过未折叠蛋白反应调节内质网的功能2511

300．从线粒体到胞浆及核的信号通路2527

301．凋亡信号：走向完结的手段2535

302．细胞周期过程调节2545

303．细胞器分裂及遗传中的信号：过氧化物酶体2555

304．核包被中的信号2563

305．肌动蛋白动力学与胞吞作用的双向交流2571

306．自噬相关通路信号2583

第五部分 细胞-细胞及细胞-基质互作2589

307．细胞-细胞及细胞-基质互作概述2591

308．脉管系统中的互作信号通路2593

309．心脏形成中的信号通路2601

310．胰腺发生中的调节信号：胰腺癌中异常信号的暗示2611

311．胃肠管道中肠激素的营养效应2621

312．神经营养因子2631

313．骨中的细胞-细胞及细胞-基质互作2647

314．睾丸及卵巢中的细胞-细胞信号2663

315．T淋巴细胞中的信号转导2679

316．由B细胞抗原受体介导的信号转导：B细胞生物学的主要调节因子2689

317．正常与增生的乳腺中的信号通路2699

318．肾脏2707

319．在造血过程中调节细胞存活、增殖和分化的细胞因子及细胞因子受体2733

320．调节成体干细胞生长及分化的信号通路2743

321．体细胞网络信号图景2753

第六部分 疾病病理学：转化启示2759

322．Ras家族小GTPase在乳腺癌中的作用2763

323．前列腺癌中基质与上皮细胞相互作用的转化医学启示及干细胞／前体细胞的潜在功能2773

324．胰腺癌中的异常信号通路：靶向治疗的机遇2783

325．液态骨髓分隔物中多重骨髓瘤细胞克隆的进化与保留：治疗的暗示2799

326．骨髓环境的病理生理学功能及其在多重骨髓瘤中的微环境2811

327．骨髓性白血病的信号靶点2821

328．淋巴性白血病的信号靶点2831

329．以Ras为靶点探索抗癌药物2837

330．以EWS/FLI1驱动的信号通路作为针对Ewing's家族性肉瘤的治疗靶点2859

331．中枢及周围组织中的IRS蛋白骨架及胰岛素／IGF活性2873

332．脂肪动员信号：肥胖症的暗示2885

333．以血管生成信号为癌症治疗的靶点2895

334．间质性肺病中的CXC趋化因子信号2907

335．系统性硬化症2913

336．类风湿性关节炎及系统性红斑狼疮中的信号转导2919

337．脉管炎中的转化概念2933

338．在理解炎症性肠道疾病病理方面的进展2945

339．蛋白组学的转化医学启示2959

340．microRNA在临床诊断与治疗中的转化医学启示2965

索引2983