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第一节 微生物和寄生虫1

一、微生物1

绪论1

一、病原生物2

第二节 病原生物和病原生物学2

二、寄生虫2

二、病原生物在患者体内的存在部位、存在形式及其时间过程3

一、病原生物感染后患者的特殊症状和体征3

二、病原生物学3

三、病原生物的消亡、出现与再现3

第三节 临床检验病原生物学3

三、实验室的生物安全4

二、致病菌的耐药性监测4

三、病原生物生长的营养和环境条件4

四、病原生物的分类、鉴定特征4

五、患者感染后的免疫反应4

第四节 当今临床检验病原生物学的关注热点4

一、新出现的感染性疾病4

八、病原生物学检验的标准化和规范化5

七、病原生物学检验的全面质量控制5

四、警惕、研究和防止生物恐怖5

五、病原生物的分子诊断5

六、病原生物学检验的自动化5

二、命名9

一、分类9

第一篇 临床检验病原生物学总论9

第一章　细菌系统分类学概述9

第一节 分类和命名9

一、鉴定原则11

第二节 鉴定11

三、中文译名11

一、细菌的表型特征12

第三节 根据表型进行分类和鉴定的方法12

二、鉴定步骤12

一、DNA的（G+C）mol%13

第四节 遗传学分类方法13

二、编码鉴定13

四、rRNA寡核苷酸测序技术14

三、DNA-rRNA杂交14

二、DNA-DNA杂交14

七、其他进化同源基因的测定15

六、16S～23SrRNA间区15

五、rRNA全序列分析法15

一、人体的正常菌群17

第一节 人体的常驻微生物17

第二章 人体常驻微生物及致病微生物17

二、正常菌群与人体的微生态平衡18

第二节 人间传染的病原微生物19

三、正常菌群与人体的微生态失调19

一、微生物的致病性31

第三节 微生物的致病性及致病机制31

三、毒素及毒性蛋白和酶32

二、黏附与定植32

四、细胞内寄生微生物的致病作用33

一、感染的条件34

第四节 微生物的致病条件及类型34

五、免疫病理损害34

二、感染的类型35

第一节 感染的临床证据37

第三章 感染的证据37

二、局部感染的常见症状和体征38

一、全身感染的常见症状和体征38

三、感染性疾病中有诊断意义的特殊症状和体征39

一、感染性疾病流行的基本要素40

第二节 感染的流行病学证据40

二、有利于感染诊断的其他要素41

一、柯赫法则与感染的病原学证据42

第三节 感染的病原学证据42

二、细菌感染的病原学证据43

三、真菌感染的病原学证据46

四、病毒感染的病原学证据47

五、寄生虫感染的病原学证据48

第四章　病原微生物感染的诊断技术51

三、染色标本的检查52

二、不染色标本的检查52

第一节 显微镜检查52

一、显微镜52

一、细菌的分离培养54

第二节 分离培养54

二、病毒的分离培养56

二、细菌外毒素的检测58

一、细菌内毒素的检测58

三、真菌的分离培养58

第三节 毒素的检测58

二、V-P试验59

一、糖（醇）发酵试验59

第四节 生化反应59

八、靛基质试验60

七、硝酸盐还原试验60

三、甲基红试验60

四、枸橼酸盐利用试验60

五、缩苹果酸盐（丙二酸盐）利用试验60

六、氰化钾抑制试验60

十五、赖氨酸脱羧试验61

十四、苯丙氨酸脱氨酶试验61

九、硫化氢生成试验61

十、尿素分解试验61

十一、明胶液化试验61

十二、氧化酶试验61

十三、触酶试验61

一、凝集反应62

第五节 免疫学技术62

十六、血浆凝固酶试验62

十七、耐热核酸酶试验62

二、免疫荧光技术63

一、核酸杂交技术64

第六节 分子生物学技术64

三、酶联免疫吸附试验64

二、聚合酶链反应66

三、生物芯片技术67

一、自动化血培养系统68

第八节 细菌检验的自动化68

第七节 动物实验68

二、自动化微生物鉴定系统69

三、自动化药物敏感性试验系统70

一、微生物常用保存方法74

第一节 微生物的保存74

第五章 微生物的保存与管理74

三、操作步骤及各保存方法的应用范围75

二、主要器材75

一、保管规则和制度77

第三节 微生物的管理77

第二节 真菌及病毒的保存方法77

一、真菌的蒸馏水保存法77

二、病毒的保存方法77

二、菌种保藏机构78

第一节 分析前质量管理79

第六章 临床微生物实验室的全面质量管理79

二、送检标本的管理80

一、检验项目的管理80

一、标准操作程序81

第二节 分析中质量管理81

二、室内质量控制82

三、室间质量评估90

二、专业咨询服务91

一、检测报告91

第三节 分析后质量管理91

一、分类97

第一节 葡萄球菌属97

第二篇 临床检验细菌学各论97

第七章　球菌97

四、种属鉴定98

三、形态和培养特征98

二、临床意义98

一、分类100

第二节 链球菌属100

二、临床意义101

三、形态和培养特征102

四、种属鉴定103

一、分类104

第三节 肠球菌属104

四、种属鉴定105

三、形态和培养特征105

二、临床意义105

二、临床意义107

一、分类107

第四节 奈瑟菌属107

三、形态和培养特征108

四、种属鉴定109

第八章　肠杆菌科细菌112

一、分类113

第一节 概述113

三、生物学特征114

二、临床意义114

四、种属鉴定115

二、临床意义116

一、分类116

第二节 埃希菌属116

四、种属鉴定117

三、形态和培养特征117

三、形态和培养特征120

二、临床意义120

第三节 志贺菌属120

一、分类120

一、分类121

第四节 沙门菌属121

四、种属鉴定121

五、抗原结构与血清学分型121

三、形态和培养特征122

二、临床意义122

四、种属鉴定123

五、抗原结构与血清学分型124

二、临床意义126

一、分类126

六、血清抗体检测及诊断意义126

第五节 耶尔森菌属126

三、形态和培养特征127

四、种属鉴定128

一、分类129

第六节 枸橼酸杆菌属129

四、种属鉴定130

三、形态和培养特征130

二、临床意义130

一、分类131

第七节 克雷伯菌属和柔特勒菌属131

三、形态和培养特征132

二、临床意义132

四、种属鉴定133

三、形态和培养特征134

二、临床意义134

第八节 肠杆菌属134

一、分类134

四、种属鉴定135

一、分类136

第十节 哈夫尼亚菌属136

第九节 多源菌属136

一、分类136

二、临床意义136

三、形态和培养特征136

四、种属鉴定136

三、形态和培养特征137

二、临床意义137

二、临床意义137

三、形态和培养特征137

四、种属鉴定137

第十一节 沙雷菌属137

一、分类137

四、种属鉴定138

二、临床意义139

一、分类139

第十二节 变形杆菌属139

四、种属鉴定140

三、形态和培养特征140

四、种属鉴定141

三、形态和培养特征141

五、抗原结构和分型141

第十三节 普罗威登斯菌属141

一、分类141

二、临床意义141

四、种属鉴定142

三、形态和培养特征142

第十四节 摩根菌属142

一、分类142

二、临床意义142

四、种属鉴定143

三、形态和培养特征143

第十五节 邻单胞菌属143

一、分类143

二、临床意义143

一、西地西菌属144

第十六节 与临床有关的其他肠杆菌科细菌144

三、克卢瓦菌属145

二、爱德华菌属145

四、塔特姆菌属146

一、分类148

第一节 弧菌属148

第九章 弧菌科和气单胞菌科148

二、临床意义149

三、形态和培养特征150

四、种属鉴定151

五、其他弧菌154

二、临床意义155

一、分类155

第二节 气单胞菌属155

四、种属鉴定156

三、形态和培养特征156

第十章　非发酵革兰阴性杆菌158

三、形态和培养特征159

二、临床意义159

第一节 假单胞菌属159

一、分类159

四、种属鉴定161

二、临床意义163

一、分类163

第二节 不动杆菌属163

四、种属鉴定164

三、形态和培养特征164

一、窄食单胞菌属165

第三节 其他临床常见非发酵菌165

二、伯克霍尔德菌属166

三、产碱杆菌属和无色杆菌属168

四、金色杆菌属170

五、莫拉菌属172

六、军团菌属175

二、临床意义180

一、分类180

第十一章 嗜血杆菌及其他革兰阴性杆菌180

第一节 嗜血杆菌属180

四、种属鉴定181

三、形态和培养特征181

一、巴斯德菌属182

第二节 其他革兰阴性杆菌182

三、布鲁菌属183

二、弗朗西斯菌属183

四、鲍特菌属184

第十二章 革兰阳性需氧杆菌187

二、临床意义188

一、分类188

第一节 芽胞杆菌属188

三、形态和培养特征189

四、种属鉴定190

二、临床意义191

一、分类191

第二节 李斯特菌属191

四、种属鉴定192

三、形态和培养特征192

三、形态和培养特征194

二、临床意义194

第三节 丹毒丝菌属194

一、分类194

一、分类195

第四节 棒状杆菌属195

四、种属鉴定195

二、临床意义196

三、形态和培养特征197

四、种属鉴定199

二、临床意义200

一、分类200

第五节 加特纳菌属200

三、形态和培养特征201

一、分类202

第六节 分枝杆菌属202

四、种属鉴定202

二、临床意义203

三、形态和培养特征205

四、种属鉴定206

三、形态和培养特征208

二、临床意义208

第七节 放线菌属208

一、分类208

四、种属鉴定209

三、形态和培养特征210

二、临床意义210

第八节 诺卡菌属210

一、分类210

四、种属鉴定211

一、厌氧菌的概念与种类215

第一节 概述215

第十三章　厌氧菌215

二、临床意义216

三、厌氧菌的微生物学检验217

一、消化链球菌属222

第二节 厌氧性球菌222

二、消化球菌属223

三、韦荣球菌属224

一、拟杆菌属225

第三节 革兰阴性无芽胞厌氧杆菌225

二、普雷沃菌属227

三、卟啉单胞菌属228

四、梭杆菌属229

第四节 革兰阳性无芽胞厌氧杆菌230

一、双歧杆菌属231

二、丙酸杆菌属232

三、真杆菌属233

四、乳杆菌属234

一、破伤风梭菌236

第五节 梭状芽胞杆菌属236

二、产气荚膜梭菌238

三、肉毒梭菌239

四、艰难梭菌240

一、分类243

第一节 弯曲菌属243

第十四章　弯曲菌属与螺杆菌属243

三、形态和培养特征244

二、临床意义244

四、种属鉴定245

第二节 螺杆菌属246

三、形态和培养特征247

二、临床意义247

一、分类247

四、种属鉴定248

一、分类250

第一节 概述250

第十五章　螺旋体250

二、临床意义251

第二节 钩端螺旋体252

四、实验诊断252

三、生物学特性252

三、生物学特性253

二、临床意义253

一、分类253

第三节 疏螺旋体254

四、实验诊断254

一、伯氏疏螺旋体255

二、回归热疏螺旋体256

一、苍白密螺旋体苍白亚种257

第四节 密螺旋体257

三、奋森疏螺旋体257

二、其他密螺旋体258

二、临床意义260

一、分类260

第十六章　支原体、衣原体、立克次体260

第一节 支原体260

四、实验室诊断261

三、生物学特性261

二、临床意义264

一、分类264

第二节 衣原体264

四、实验室诊断265

三、生物学特性265

四、实验室诊断268

三、生物学特性268

第三节 立克次体268

一、分类268

二、临床意义268

二、触酶阴性革兰阳性球菌273

一、触酶阳性革兰阳性球菌273

第三篇 临床细菌学检验273

第十七章 常见致病菌的初步分群和鉴定273

第一节 需氧革兰阳性球菌的初步分群和鉴定273

二、革兰阳性不规则杆菌274

一、革兰阳性规则杆菌274

第二节 需氧革兰阳性杆菌的初步分群和鉴定274

二、易培养的需氧革兰阴性杆菌275

一、易培养的需氧革兰阴性球菌275

第三节 易培养的需氧革兰阴性菌的初步分群和鉴定275

三、苯丙氨酸脱氨酶试验阴性而七叶苷水解试验阳性（PNEP）菌276

二、苯丙氨酸脱氨酶试验阳性而七叶苷水解试验阴性（PPEN）菌276

第四节 肠杆菌科细菌分群276

一、苯丙氨酸脱氨酶试验和七叶苷水解试验同时阳性（PPEP）菌276

四、苯丙氨酸脱氨酶试验和七叶苷水解试验同时阴性（PNEN）菌278

第五节 易培养不发酵葡萄糖革兰阴性杆菌分群280

第七节 常见厌氧菌初步分群282

二、BAP不生长细菌的鉴定282

第六节 难培养的革兰阴性细菌282

一、BAP生长不良细菌的鉴定282

三、厌氧球菌的鉴别283

二、厌氧革兰阳性（染色不定）球菌或球杆菌的鉴别283

一、厌氧革兰阴性杆菌或球杆菌的鉴别283

第八节 常见微需氧菌初步分群284

二、血液标本的采集285

一、采血指征285

第十八章 血液标本的细菌学检验285

第一节 标本的采集和运送285

一、标本的验收286

第二节 标本的验收、培养、分离和鉴定286

三、标本的运送286

二、标本的培养、分离和鉴定287

二、阴性结果报告288

一、阳性结果报告288

第三节 报告及解释288

二、标本采集289

一、标本采集指征289

第十九章　穿刺液、引流液标本的细菌学检验289

第一节 标本的采集和运送289

二、标本的培养、分离和鉴定290

一、标本的验收290

三、标本运送290

第二节 标本的验收、培养、分离和鉴定290

二、阴性结果报告291

一、阳性结果报告291

第三节 报告与解释291

二、标本的采集293

一、标本采集指征293

第二十章 脑脊液标本的细菌学检验293

第一节 标本的采集和运送293

二、标本的显微镜检查294

一、标本的验收294

三、标本的运送294

第二节 标本的验收、培养、分离和鉴定294

二、阴性结果报告295

一、阳性结果报告295

三、标本的培养、分离和鉴定295

第三节 报告及解释295

第二十一章 尿液标本的细菌学检验297

三、标本的运送298

二、标本的采集298

第一节 尿液标本的采集和运送298

一、送检指征298

二、标本的培养、分离和鉴定299

一、标本验收与不合格标本的处理299

第二节 标本的验收、培养、分离和鉴定299

二、阴性结果报告300

一、阳性结果报告300

第三节 报告及解释300

二、标本的采集302

一、送检指征302

第二十二章　痰液标本的细菌学检验302

第一节 标本的采集和运送302

二、标本的显微镜检查303

一、标本的验收303

三、标本的运送303

第二节 标本的验收、培养、分离和鉴定303

三、标本的培养、分离和鉴定304

二、阴性结果报告305

一、阳性结果报告305

第三节 报告及解释305

二、标本的采集307

一、送检指征307

第二十三章　生殖道标本的细菌学检验307

第一节 标本的采集和运送307

二、标本的显微镜检查308

一、标本的验收308

三、标本的运送308

第二节 标本的验收、培养、分离和鉴定308

三、标本的培养、分离和鉴定309

二、阴性结果报告310

一、阳性结果报告310

第三节 报告及解释310

一、标本的采集311

第一节 标本的采集、运送和保存311

第二十四章　粪便标本的细菌学检验311

二、标本的显微镜检查312

一、标本的验收312

二、标本的运送312

三、标本的保存312

第二节 标本的验收、培养、分离和鉴定312

三、标本的培养、分离和鉴定313

一、镜检结果报告314

第三节 报告及解释314

二、细菌培养结果报告315

一、采集指征316

第一节 标本的采集和运送316

第二十五章　脓液及分泌物标本的细菌学检验316

二、采集方法317

一、标本的验收318

第二节 标本的验收、培养、分离和鉴定318

三、标本的保存和运送318

二、标本的培养、分离和鉴定319

二、阴性结果报告321

一、阳性结果报告321

第三节 报告与解释321

第二十六章 常见真菌的分类与命名325

第四篇 常见真菌感染的实验室诊断325

二、真菌的命名326

一、真菌的分类326

第一节 真菌的分类和命名326

第二节 常见真菌327

二、皮肤癣真菌329

一、表面感染真菌329

第二十七章 浅部感染真菌的实验室诊断329

第一节 常见浅部真菌感染329

二、标本采集的方法和注意事项331

一、标本采集的类别331

第二节 标本的采集331

二、分离培养与鉴定333

一、标本的直接检查333

第三节 实验室诊断333

二、分离、培养与鉴定334

一、显微镜检查334

三、免疫学检测334

第四节 报告及解释334

一、假丝酵母菌335

第一节 常见深部真菌感染335

第二十八章 深部真菌感染的实验室诊断335

二、隐球菌336

三、曲霉菌337

四、毛霉菌338

五、组织胞浆菌339

七、皮下组织感染真菌340

六、卡氏肺孢菌340

二、标本采集的方法和注意事项341

一、标本采集的类别341

第二节 标本的采集341

二、分离培养与鉴定342

一、标本的直接检查342

第三节 实验室诊断342

三、免疫学检测343

七、药物敏感试验344

六、真菌毒素的检测344

四、核酸检测344

五、组织病理学检测344

三、其他345

二、培养和鉴定345

第四节 报告及解释345

一、显微镜检查345

一、病毒分类原则349

第一节 病毒的分类349

第五篇 常见病毒感染的实验室诊断349

第二十九章　病毒的分类与命名349

二、分类和命名的规则350

三、亚病毒351

二、消化道感染病毒352

一、呼吸道感染病毒352

第二节 临床常见病毒352

五、皮肤黏膜感染的病毒353

四、肝炎病毒353

三、虫媒病毒和出血热病毒353

六、其他病毒354

二、临床意义356

一、分类356

第三十章　流行性感冒病毒、冠状病毒及SARS-冠状病毒356

第一节 流行性感冒病毒356

四、实验室诊断357

三、生物学特性357

二、临床意义359

一、分类359

第二节 冠状病毒及SARS-冠状病毒359

四、实验室诊断360

三、生物学特性360

二、临床意义363

一、分类363

第三十一章　肝炎病毒363

第一节 甲型肝炎病毒363

四、实验室诊断364

三、生物学特性364

一、分类365

第二节 乙型肝炎病毒365

三、生物学特性366

二、临床意义366

四、实验室诊断367

三、生物学特性369

二、临床意义369

第三节 丙型肝炎病毒369

一、分类369

二、临床意义370

一、分类370

四、实验室诊断370

第四节 丁型肝炎病毒370

四、实验室诊断371

三、生物学特性371

四、实验室诊断372

三、生物学特性372

第五节 戊型肝炎病毒372

一、分类372

二、临床意义372

一、传染源和传播途径375

第二节 临床意义375

第三十二章　人类免疫缺陷病毒375

第一节 分类375

三、致病机制376

二、临床表现376

一、形态与结构377

第三节 生物学特性377

四、机体对HIV感染的免疫应答377

二、基因组结构及其编码产物378

五、病毒受体379

四、病毒的变异379

三、病毒的复制379

一、检测抗体380

第四节 实验室诊断380

六、培养特性380

七、抵抗力380

四、报告及解释381

三、病毒分离381

二、病毒组分检测381

一、脊髓灰质炎病毒383

第一节 肠道病毒383

第三十三章　肠道病毒与急性胃肠炎病毒383

二、柯萨奇病毒与埃可病毒385

第二节 急性胃肠炎病毒386

三、新型肠道病毒386

一、轮状病毒387

三、杯状病毒388

二、肠道腺病毒388

四、星状病毒389

三、生物学特性391

二、临床意义391

第三十四章　人巨细胞病毒、单纯疱疹病毒391

第一节 巨细胞病毒391

一、分类391

四、实验室诊断392

二、临床意义394

一、分类394

第二节 单纯疱疹病毒394

四、实验室诊断395

三、生物学特性395

二、人体寄生虫的分布401

一、人体寄生虫的种类401

第六篇 常见寄生虫感染的实验室诊断401

第三十五章　寄生虫感染概述401

第一节 人体寄生虫的种类、分布与流行趋势401

三、寄生虫病流行的新态势402

二、寄生虫感染与寄生虫病错综复杂403

一、带虫者、隐性感染、慢性感染多403

第二节 寄生虫感染与寄生虫病的特点403

第三节 寄生虫的分类404

三、寄生虫病的误诊情况严重404

一、分类406

第一节 鞭毛虫406

第三十六章 医学原虫感染的实验室诊断406

三、形态特征407

二、临床意义407

四、实验室诊断410

二、临床意义411

一、分类411

第二节 叶足虫411

三、形态特征413

四、实验室诊断416

一、分类417

第三节 孢子虫417

二、临床意义418

三、形态特征422

四、实验室诊断426

二、临床意义428

一、分类428

第四节 纤毛虫428

四、实验室诊断429

三、形态特征429

一、分类431

第一节 吸虫431

第三十七章 医学蠕虫及节肢动物感染的实验室诊断431

二、临床意义432

三、形态特征433

四、实验室诊断438

二、临床意义439

一、分类439

第二节 绦虫439

三、形态特征441

四、实验室诊断445

一、分类446

第三节 线虫446

二、临床意义447

三、形态特征449

四、实验室诊断455

二、临床意义456

一、分类456

第四节 医学节肢动物456

三、形态特征458

四、实验室诊断460

第七篇 抗菌药物敏感性试验及细菌耐药性检测第三十八章 抗菌药物的敏感性试验465

一、常用抗菌药物466

第二节 药敏试验用药的选择和分组466

第一节 抗菌药物敏感性试验的目的及试验指征466

一、抗菌药物敏感性试验的目的466

二、抗菌药物敏感性试验的指征466

二、药敏试验用药的选择依据和方法467

三、药敏试验用抗菌药物的分组469

一、纸片扩散法药敏试验470

第四节 抗菌药物敏感性试验的方法470

第三节 敏感、中介和耐药的概念470

一、敏感470

二、耐药470

三、中介470

二、稀释法药敏试验472

三、浓度梯度纸条扩散法473

一、抗菌药物的联合药敏试验474

第五节 抗菌药物药效学的其他试验474

二、抗菌药物的杀菌活性475

三、抗菌药物的后效应477

二、抗菌药的PK/PD分类478

一、某种属细菌的MIC值的分布478

第六节 抗菌药物敏感性试验敏感折点的确定478

五、MIC值与抑菌圈直径的相关性479

四、临床和细菌学的应答率479

三、根据PK/PD理论推算抗菌药的敏感折点479

第三十九章　细菌耐药性的检测481

一、产生灭活抗生素的各种酶482

第一节 细菌的耐药机制482

一、β-内酰胺酶的检测483

第二节 细菌耐药表型的检测483

二、改变药物作用靶位483

三、限制抗菌药的进入和主动外排483

二、重要耐药菌的检测485

第三节 细菌耐药基因型的检测487

一、医院感染病原体493

第一节 医院感染的流行病学特点493

第八篇 医院感染实验室监测与诊断493

第四十章　医院感染493

二、常见医院感染494

一、医院感染的监测495

第二节 医院感染的监测及暴发流行的识别495

三、医院感染的来源495

四、医院感染的预防与控制495

二、暴发流行的识别496

第一节 医院感染病原体的分离鉴定497

第四十一章 医院感染的微生物学检测497

三、特殊的分型技术498

二、生物分型498

一、抗菌药物敏感性表型研究498

第二节 环境与医务人员标本的培养499

中英名词索引500

英中名词索引511

主要参考文献522

国内外专业网站524