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综合情况3

中国科学院领导集体3

中国科学院院设委员会4

中国科学院院部机关机构5

中国科学院院属机构变更9

综述10

规划与战略20

科研管理26

重大科技成果33

队伍建设与人才培养62

基础设施与支撑条件66

科技成果转移转化与对外合作82

国际合作89

基本建设97

党群工作与创新文化99

科学传播103

中国科学院2016年大事记106

学部与院士工作131

中国科学院学部领导机构131

2016年中国科学院院士名单135

2016年中国科学院外籍院士名单139

2016年逝世的中国科学院院士名单142

2016年逝世的中国科学院外籍院士名单143

中国科学院第十八次院士大会情况144

咨询评议工作145

科学道德建设146

学术与出版工作147

科学普及与教育工作148

陈嘉庚科学奖基金会工作149

院直属单位情况153

分院机构153

北京分院（筹）153

沈阳分院156

长春分院158

上海分院160

南京分院163

武汉分院165

广州分院167

成都分院169

昆明分院171

西安分院173

兰州分院176

新疆分院178

科研机构181

数学与系统科学研究院181

物理研究所183

理论物理研究所185

高能物理研究所187

力学研究所189

声学研究所190

理化技术研究所192

化学研究所194

国家纳米科学中心196

生态环境研究中心197

过程工程研究所200

地理科学与资源研究所202

国家天文台204

遥感与数字地球研究所207

地质与地球物理研究所208

青藏高原研究所210

古脊椎动物与古人类研究所212

大气物理研究所214

植物研究所216

动物研究所217

心理研究所220

微生物研究所221

生物物理研究所223

遗传与发育生物学研究所225

北京基因组研究所226

计算技术研究所228

软件研究所230

半导体研究所232

微电子研究所234

电子学研究所236

自动化研究所237

电工研究所239

工程热物理研究所241

国家空间科学中心242

光电研究院244

自然科学史研究所246

科技战略咨询研究院248

信息工程研究所250

空间应用工程与技术中心251

北京综合研究中心252

天津工业生物技术研究所254

山西煤炭化学研究所256

大连化学物理研究所257

金属研究所259

沈阳应用生态研究所261

沈阳自动化研究所262

海洋研究所264

青岛生物能源与过程研究所266

烟台海岸带研究所268

长春光学精密机械与物理研究所269

长春应用化学研究所271

东北地理与农业生态研究所273

上海微系统与信息技术研究所275

上海技术物理研究所277

上海光学精密机械研究所279

上海硅酸盐研究所281

上海有机化学研究所283

上海应用物理研究所284

上海天文台286

上海生命科学研究院288

上海药物研究所291

上海高等研究院293

宁波材料技术与工程研究所295

福建物质结构研究所（海西研究院）297

城市环境研究所299

南京地质古生物研究所300

南京土壤研究所302

南京地理与湖泊研究所304

紫金山天文台305

苏州纳米技术与纳米仿生研究所308

苏州生物医学工程技术研究所310

合肥物质科学研究院312

武汉岩土力学研究所314

武汉物理与数学研究所316

武汉病毒研究所318

测量与地球物理研究所319

水生生物研究所321

武汉植物园323

南海海洋研究所324

华南植物园327

广州能源研究所329

广州地球化学研究所330

广州生物医药与健康研究院332

深圳先进技术研究院334

亚热带农业生态研究所336

成都生物研究所337

成都山地灾害与环境研究所339

光电技术研究所341

重庆绿色智能技术研究院343

昆明动物研究所345

昆明植物研究所347

西双版纳热带植物园349

地球化学研究所350

西安光学精密机械研究所352

国家授时中心354

地球环境研究所355

近代物理研究所357

兰州化学物理研究所359

寒区旱区环境与工程研究所（西北生态环境资源研究院）360

青海盐湖研究所363

西北高原生物研究所364

新疆理化技术研究所366

新疆生态与地理研究所368

学校及公共支撑单位370

中国科学院大学370

中国科学技术大学372

计算机网络信息中心375

文献情报中心376

其他机构380

中国科学报社380

行政管理局381

青岛疗养院384

庐山疗养院385

院直接投资的全资及控股企业387

中国科学院国有资产经营有限责任公司387

联想控股股份有限公司391

中科实业集团（控股）有限公司391

东方科仪控股集团有限公司393

中国科技出版传媒集团有限公司395

中国科技产业投资管理有限公司397

北京中科科仪股份有限公司397

北京中科院软件中心有限公司399

中科院建筑设计研究院有限公司401

北京中科资源有限公司402

中国科学院沈阳计算技术研究所有限公司404

中国科学院沈阳科学仪器股份有限公司405

中科院南京天文仪器有限公司407

中科院广州化学有限公司408

中科院广州电子技术有限公司409

中国科学院成都有机化学有限公司410

中科院成都信息技术股份有限公司411

成都中科唯实仪器有限责任公司412

中科院科技服务有限公司413

上海碧科清洁能源技术有限公司414

深圳中科院知识产权投资有限公司415

国科嘉和（北京）投资管理有限公司416

截至2016年底院设非法人单元列表418