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基因表达序列标签 EST 数据分析手册
  • 胡松年主编 著
  • 出版社: 杭州:浙江大学出版社
  • ISBN:7308041867
  • 出版时间:2005
  • 标注页数:236页
  • 文件大小:5MB
  • 文件页数:249页
  • 主题词:基因表达-数据-分析-手册

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图书目录

第1章 基因表达序列标签(EST)及其应用 胡松年1

1.1 简介1

1.2 EST的应用2

1.3 EST测序分析流程7

1.4 参考文献12

第2章 EST数据分析平台的构建 柴惠 王建斌 陶林 傅衍13

2.1 简介13

2.2 硬件设备13

2.3 Unix/Linux操作系统及其常用命令15

2.4 常用EST数据分析软件的安装22

2.5 参考文献39

3.2 文献检索41

3.1 简介41

第3章 EST信息检索及常用数据库 曾晓维 张忠华 傅衍41

3.3 文献管理55

3.4 EST数据库56

3.5 参考文献83

第4章 EST聚类,常见问题及解决方法 王建斌 陈欢 傅衍85

4.1 简介85

4.2 EST序列聚类方法86

4.3 EST聚类中常见的问题及解决方法100

4.4 参考文献101

第5章 EST数据注释及多序列比对 方永军 张兵 薛庆中103

5.1 简介103

5.2 序列比对(BLAST)104

5.3 InterPro111

5.4 多序列比对(Clustal W)120

5.5 参考文献126

第6章 EST功能分类与代谢途径分析 李娟 刘贵明 薛庆中128

6.1 简介128

6.2 EST功能分类128

6.3 EST代谢途径分析138

6.4 EST对应基因产物系统分析143

6.5 参考文献149

第7章 基因核苷酸序列分析 贾佳 杨柳 薛庆中152

7.1 简介152

7.2 基因开放阅读框的识别152

7.3 内含子/外显子剪切位点识别158

7.4 基因调控区域分析171

7.5 密码子使用偏性分析180

7.6 限制性核酸内切酶位点分析185

7.7 核苷酸序列综合分析软件188

7.8 参考文献192

第8章 蛋白质序列分析 贾佳 杨柳 薛庆中195

8.1 简介195

8.2 蛋白质理化性质分析195

8.3 蛋白质二级结构预测200

8.4 蛋白质结构域205

8.5 蛋白质三维结构预测206

8.6 分子系统发育分析216

8.7 参考文献225

索引229

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